从全厚人肠组织切除中单细胞分离,用于单细胞RNA测序
Gail A West1, Shuai Zhao1, Quang Tam Nguyen2
1Department of Inflammation and Immunity, Lerner Research Institute, Cleveland Clinic, Cleveland, OH, USA.
STAR protocols
|November 5, 2023
概括
这项研究详细介绍了一种从肠道组织中分离单细胞的方法. 该协议使得下游分析,如RNA测序,以更深入地了解细胞功能.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 胃肠病学 胃肠病学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 研究细胞关系需要将单个细胞从复杂组织中分离出来.
- 目前的方法可能无法优化所有组织类型,包括肠道.
研究的目的:
- 提出从全厚肠道组织中单细胞分离的详细方案.
- 为了实现下游应用,如单细胞RNA测序.
主要方法:
- 样品的预处理和肠道层 (lamina propria和muscularis) 的剖析.
- 红细胞溶解和细胞固定程序.
- 隔离后的细胞质量评估.
主要成果:
- 一个强大的协议,用于从肠切除中获得单细胞悬浮液.
- 孤立细胞的适应性已被证明适用于10x Genomics Chromium平台.
结论:
- 该协议提供了一种可靠的方法,用于从肠道组织中分离单细胞.
- 促进了肠道细胞群及其相互作用的先进分析.
