从单个淋巴结站内的顺序内支气管超声波跨支气管针吸收样本报告的瘤突变负担的差异 - 简要报告
David Fielding1,2, Andrew J Dalley2, Mahendra Singh2,3
1Department of Thoracic Medicine, The Royal Brisbane & Women's Hospital, Brisbane, QLD, Australia.
Frontiers in oncology
|November 6, 2023
概括
通过EBUS-TBNA细胞学涂抹进行瘤突变负担 (TMB) 评估是可行的. 虽然大多数配对样本显示TMB的变化很小,但瘤含量和采样地点可能会影响结果,需要进一步调查.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 瘤突变负担 (TMB) 是预测对癌症免疫疗法的反应的关键生物标志物.
- 准确的TMB评估对于指导治疗决策至关重要.
- 在细胞学样本中研究TMB变异性对于临床应用至关重要.
研究的目的:
- 评估TMB评估的可行性和可重复性从内支气管超声波跨支气管针吸收 (EBUS-TBNA) 细胞学涂抹.
- 在结对的EBUS-TBNA样本中确定影响TMB变异性的因素.
- 为了确定样本处理对TMB估计的影响.
主要方法:
- 细胞学涂抹是从恶性淋巴结的EBUS-TBNA样本中准备的.
- 从Diff-Quik染色涂抹中提取了DNA,并使用TruSight瘤500 (TSO500) 面板进行了测序.
- 使用TSO500本地应用程序v. 2.0.0.计算了TMB.
主要成果:
- 从EBUS-TBNA涂抹中进行TMB评估是可行的,平均TMB为8.7个突变/Mb.
- 大多数配对样本 (16/20名患者) 显示了最小的TMB差异 (平均1.3个突变/Mb).
- 影响TMB调用的因素包括瘤含量,DNA数量和内瘤异质性.
结论:
- 通过单个EBUS-TBNA通行证可以实现TMB评估.
- 配对的淋巴结样本通常显示TMB的变化很低,但瘤含量和采样地点可能会导致差异.
- 需要进一步的研究来优化TMB测试的样本处理 (例如,聚合与独立测试).
