ProbioMinServer:一个综合平台,用于评估潜在益生菌菌株的安全性和功能性质

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 生物信息学是一种生物信息学.
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 益生菌是功能性食品,在医疗保健中具有关键的安全性和功能性方面.
• 基因组学,特别是下一代测序,对于评估益生菌性质越来越重要.
• 现有的平台缺乏综合工具,可以同时评估益生菌的安全性,功能性和植物遗传识别.

研究的目的:

• 开发ProbioMinServer,这是一个综合平台,用于全面的益生菌菌株分析.
• 为研究人员提供一个工具来评估益生菌的安全性 (例如,抗菌素耐药性,毒性) 和功能 (例如,酶概况).
• 为了能够识别已知的基因系相关的益生菌菌株.

主要方法:

• ProbioMinServer可以接受以FASTA格式的全基因组序列.
• 它分析了常见益生菌物种的核心基因组多部位序列类型.
• 该平台使用JavaScript,PHP,Perl和Python作为其前端和后端基础设施.

主要成果:

• ProbioMinServer已经成功构建和实施.
• 该平台有助于快速轻松地检索益生菌的安全性和功能数据.
• 它支持在其数据库中分析25种常见的益生菌物种.

结论:

• ProbioMinServer解决了对益生菌研究的综合平台的需求.
• 该平台通过基因组分析增强了益生菌安全性和功能性的评估.
• 它使研究人员能够在食品和料中的益生菌应用方面做出明智的决定.