转录组分析揭示了涉及到Sanghuangporus sanghuang中的Hispidin生物合成的假定多基基因合成酶基因

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 菌类学 菌类学是指菌类学.
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 希斯皮丁是一种重要的 styrylpyrone 化合物,由真菌 Sanghuangporus sanghuang 生产.
• 了解希斯皮丁的生物合成途径对于真菌二次代谢物研究至关重要.

研究的目的:

• 为了研究黄 (Sanghuangporus sanghuang) 中皮丁生物合成的遗传基础.
• 为了识别参与希斯皮丁生产的特定聚基因合成酶 (PKS) 基因.

主要方法:

• 对生产hispidin和非生产S. sanghuang菌株的转录组测序.
• 基因组注释以识别PKS基因.
• 定量PCR (qPCR) 和液体染色学-质谱法 (LC-MS) 用于基因表达和化合物分析.

主要成果:

• 确定了五个PKS基因;只有ShPKS1的表达与希斯皮丁产量相关.
• 结合基因表达和代谢物分析证实了ShPKS1在希斯皮丁生物合成中的作用.
• ShPKS1具有独特的域架构 (AMP-ACP-KS-AT-DH-KR-ACP-ACP),并形成了一个独特的基因组分类.

结论:

• ShPKS1是一种新型,部分降低PKS基因,对S. sanghuang的hsipidin生物合成至关重要.
• 这项研究揭示了这种重要真菌代谢物的生产中的关键酶.