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Updated: Jul 11, 2025
11:00
Biotin-based Pulldown Assay to Validate mRNA Targets of Cellular miRNAs
Published on: June 12, 2018
13.9K
发表的数据库的比较分析预测了不同物种mRNA在3'UTR中的微RNA结合
Sonu Singh Ahirwar1, Rehma Rizwan1, Samdish Sethi1
1Department of Biochemistry, All India Institute of Medical Sciences Bhopal, AIIMS Bhopal, Saket Nagar, Bhopal, MP, India.
MicroRNA (Shariqah, United Arab Emirates)
|November 6, 2023
概括
本次审查评估了微RNA目标预测数据库,发现Diana-TarBase和miRWalk对研究人员来说是最全面和最新的. 这些工具有助于选择适合生物研究的微RNA数据库.
科学领域:
- 生物化学和分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 微RNAs (miRNAs) 是生物过程的关键调节者和有价值的诊断生物标志物.
- 实验性miRNA的发现和验证是资源密集的.
- 有许多生物信息学数据库用于miRNA目标预测,但它们的多样化实用性可能会压倒新手研究人员.
研究的目的:
- 批判性地评估现有的miRNA目标预测数据库的可用性.
- 根据可访问性,效率,可解释性,可更新性和灵活性来评估数据库.
- 引导研究人员选择最合适的数据库,用于跨不同物种的3'UTR miRNA目标预测.
主要方法:
- 在PubMed,谷歌学者和Scopus进行系统的文献搜索,截至2022年11月.
- 分析了大约130个miRNA工具,重点关注31个数据库,其中包含经过验证的3'UTR miRNA目标信息.
- 纳入标准侧重于提供经过验证的3'UTR miRNA目标数据的数据库.
主要成果:
- 经过审查的数据库在各种生物研究领域中用于miRNA选择.
- 数据库包含来自不同物种的广泛miRNA数据 (525-29,806,351条目),更新至2021年.
- 大多数数据库信息都可以在网上免费访问.
结论:
- 虽然经过审查的数据库提供了有价值的信息,但准确性和货币不同.
- 迪安娜-TarBase和miRWalk被认为是最全面和最新的资源.
- 这些选定的数据库有助于有效和明智的miRNA研究.
关键词:
3 UTR 其他这是一个RNARNARNARNARNA.国家统一计划 (SNP) 是一个国家统一计划.癌症. 癌症. 在癌症.数据库就是数据库.疾病 疾病 疾病 疾病基因 基因 基因 基因这是一个小RNARNA.更多相关视频
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