DiSignAtlas:基于散装和单细胞转录组学的人类和小鼠疾病特征图谱
Zhaoyu Zhai1,2, Zhewei Lin2, Xuehang Meng2
1Precision Medicine Center, The Second Affiliated Hospital of Chongqing Medical University, Chongqing 400010, China.
Nucleic acids research
|November 6, 2023
概括
DiSignAtlas是一个新的数据库,为许多疾病提供基于转录学的分子签名. 该资源有助于研究人员从omics数据中识别诊断和治疗标记.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 分子签名对于疾病诊断,预后和治疗至关重要.
- 奥米克斯数据为识别这些签名提供了公正的全球洞察力.
- 缺乏一个全面的疾病签名资源.
研究的目的:
- 开发DiSignAtlas,一个基于转录学的疾病签名数据库.
- 策划和分析大量的转录组概况.
- 提供用于签名检索和分析的工具.
主要方法:
- 在1836种人类和小鼠疾病类型中手动修复了181,434个转录基因组概况.
- 创建了10306个比较数据集,包括328个单细胞RNA测序数据集.
- 识别了超过370万个在人类和170万个在小鼠中差异表达的基因.
主要成果:
- 在DiSignAtlas中,为各种疾病提供基于转录学的签名.
- 该数据库包括大量关于人类和小鼠差异表达基因的数据.
- 可提供功能丰富,细胞类型和特征相关性分析.
结论:
- DiSignAtlas 作为一种有价值的,全面的疾病分子签名资源.
- 该数据库为生物科学家和生物信息学家提供了翻译研究的便利.
- 它能够对疾病和物种的疾病特征进行先进的分析和比较.
