在从腹膜液中获取的无细胞瘤DNA上进行同源重组缺陷 (HRD) 测试

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 遗传学 是一个遗传学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 同源重组缺陷 (HRD) 状态对于管理先进的上皮卵巢癌 (EOC) 是至关重要的.
• HRD与BRCA1/BRCA2突变或基因组不稳定性有关,但瘤DNA分析往往没有确定性.
• 在超过95%的晚期EOC病例中,腹膜液提供了无细胞瘤DNA (ctDNA) 的可行的替代来源.

研究的目的:

• 调查HRD测试的可行性和准确性,使用晚期EOC患者腹液中的ctDNA.
• 评估下一代测序 (NGS) 和浅层全基因组测序 (sWGS) 在ctDNA上检测HRD标记物的实用性.

主要方法:

• 收集了53名EOC患者的膜/腹膜洗.
• 对TP53/HR基因进行了基于NGS的癌症基因组 (CGP) 和对cfDNA的基因组不稳定性的sWGS.
• 分析了cfDNA用于ctDNA检测,TP53,BRCA1/2变体和基因组不稳定性.

主要成果:

• 在92.5%的患者中检测到cfDNA,中位数为3700 ng/ml,周转时间为21天.
• 在86%的病例中发现TP53变异 (所有高度血清性卵巢癌),14%的BRCA1,10%的BRCA2.
• 腹膜ctDNA显示TP53检测的高灵敏度 (97%),特异性 (83%) 和一致性 (95%),成功识别了瘤检测中遗漏的BRCA2变异.

结论:

• 从腹液中分析ctDNA是一种可行且有效的方法,用于在先进的EOC中进行HRD测试.
• 这种快速可靠的方法可以进行全面的HRD评估,包括BRCA突变和基因组不稳定性.
• 对于所有接受初级腹腔镜检查的患者,应考虑对腹液cfDNA进行心脏回路检测.