NDUFA4L2是一种通过生物信息学分析发现结直肠癌的新型生物标志物
Yuning Lin1, Hongyan Xie1, Wenzhen Zhao1
1Xiamen Key Laboratory of Biomarker Translational Medicine, Medical Laboratory of Xiamen Humanity Hospital Fujian Medical University, Xiamen, China.
Medicine
|November 7, 2023
概括
线粒体蛋白质NDUFA4L2在结直肠癌 (CRC) 中表达高,与较差的存活率有关. 这项研究表明,NDUFA4L2可能成为CRC患者有前途的预后生物标志物.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 在瘤学瘤学.
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 结肠直肠癌 (CRC) 是全球癌症死亡的主要原因.
- 线粒体呼吸链子单元NDUFA4L2对于细胞能量代谢至关重要.
- 目前尚不清楚NDUFA4L2在CRC病原和进展中的具体作用.
研究的目的:
- 研究NDUFA4L2表达与结直肠癌之间的关系.
- 评估NDUFA4L2作为CRC的潜在诊断和预后生物标志物.
主要方法:
- 利用癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库进行表达分析.
- 使用了来自人类蛋白质图谱 (HPA) 数据库的免疫组织化学染色.
- 进行了统计分析,包括威尔科克森等级总和测试,奇平方测试,费舍尔精确测试,后勤回归,ROC曲线,卡普兰-梅尔和考克斯回归.
- 进行了基因本体学 (GO),基因和基因组的京都百科全书 (KEGG),基因组丰富分析 (GSEA) 和免疫透分析.
- 使用Cytoscape软件建立的蛋白质与蛋白质相互作用 (PPI) 网络.
主要成果:
- 在CRC组织中增加NDUFA4L2表达与晚期T和N阶段,病理阶段,残留瘤,围神经入侵,淋巴入侵和组织类型显著相关.
- 接收器操作特征 (ROC) 曲线分析表明NDUFA4L2具有显著的诊断和预后能力,曲线下的面积 (AUC) 为0.878.8.
- 高NDUFA4L2表达与较差的整体存活率,无进展间隔和疾病特异性存活率相关.
- 功能分析显示NDUFA4L2参与DNA调节和免疫透细胞的调节.
结论:
- 在结直肠癌中,NDUFA4L2的表达与糟糕的生存结果和改变的免疫透有显著的相关性.
- NDUFA4L2显示出作为结直肠癌的有价值的预后生物标志物的潜力.
- 进一步研究NDUFA4L2在CRC病变发生中的作用及其与免疫细胞的相互作用是有必要的.
