在质谱学中通过父子公式图表来确定母子公式和相关碎片公式
Sean Li1, Björn Bohman2,3, Gavin R Flematti2
1School of Molecular Sciences, The University of Western Australia, 35 Stirling Highway, Crawley, 6009, Australia. sean.li@research.uwa.edu.au.
这项研究提出了一种用于从质谱数据中识别分子公式的新方法,其性能优于现有的得分. 该方法通过使用父子公式图表来提高天然产品化学和代谢学方面的准确性.
科学领域:
- 质谱测量质量谱测量
- 计算化学是一种计算化学.
- 自然产品化学 自然产品化学
- 代谢学 代谢学 代谢学
背景情况:
- 准确的分子公式识别对于天然产品化学和代谢学至关重要.
- 当前的方法面临着模两可的大量信息和复杂的光谱的挑战.
- 需要新的方法来改善未知的化合物的识别.
研究的目的:
- 开发和验证一种用于从质谱数据中识别正确分子公式的新方法.
- 为了提高未知化合物的分子公式确定的准确性和效率.
- 引入一个可视化工具来评估候选分子公式.
主要方法:
- 基于父子公式图 (PSG) 的评分候选分子公式.
- 使用与PSG边缘数量相关的两个指标.
- 将该方法应用于电子冲击质谱法 (EI-MS) 和双重质谱法 (MS/MS) 数据.
- 介绍用于PSG可视化的二维碎片图 (2DFP).
主要成果:
- 与CASMI 2016和RECETOX数据集上的MS / MS得分相比,拟议的方法在正确识别母式方面表现出更好的表现.
- 在CASMI 2016上实现了76.3%的正确配方识别 (相对于58.9%) 和在RECETOX上达到66.2% (相对于59.4%).
- 在从半化学品的复杂EI-MS数据中识别正确的分子公式时,超过MS/MS得分,正确的公式出现在20/23个案例的前4名候选者中,而7/23个案例则出现在前4名候选者中.
结论:
- 该方法可靠地识别正确的父公式,即使有模糊的质量信息.
- 成功识别母式公式有助于正确识别关联的片段公式.
- 这种方法对EI-MS光谱有效,由于少量或重叠的化合物,其父离子不清楚.
- 该方法很容易实现和扩展,不需要经验参数拟合或统计学习.
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