通过选潜在的大动脉剖析生物标志物的基因,建立了一个神经网络模型,该模型是基于与热灭症相关的基因
Cheng Chen1, Lulu Gao2, Hongwei Ge1
1Department of Vascular Surgery, The Third Affiliated Hospital of Soochow University, Changzhou, Jiangsu 213000, China.
Aging
|November 8, 2023
概括
细胞死亡过程 - - 热,在大动脉剖析 (AD) 发育过程中至关重要. 研究人员确定了五个关键基因,包括CASP4和MLKL,作为早期AD诊断的潜在生物标志物.
科学领域:
- 心血管研究研究心血管研究
- 细胞生物学 细胞生物学
- 分子病理学分子病理学
背景情况:
- 大动脉解剖 (AD) 是一种重要的心血管疾病.
- 热,一种新的细胞死亡机制,与心血管疾病有关,但它在阿尔茨海默病中的作用仍然未被探索.
研究的目的:
- 为了研究热死在大动脉剖析病变的作用.
- 为了确定潜在的分子生物标志物用于早期AD诊断.
主要方法:
- 使用了两个AD基因表达数据集 (GSE153434,GSE190635).
- 进行了差异基因表达分析,基因本体学和KEGG通路丰富分析.
- 构建了一个蛋白质-蛋白质相互作用网络,并使用拉索回归和神经网络模型选生物标志物,在小鼠AD模型中验证.
主要成果:
- 确定了1033个与PI3K/Akt和MAPK信号通路相关的差异表达基因.
- 通过拉索回归确定了五种潜在的生物标志物 (PECAM1,CASP4,MLKL,APIP,HDAC6).
- 在AD中,CASP4和MLKL上调,PECAM1和HDAC6下调;APIP没有显著变化. 一个神经网络模型准确地预测了AD.
结论:
- 热是发生和发展大动脉解剖的一个关键因素.
- 已识别的生物标志物 (CASP4,MLKL,PECAM1,HDAC6) 提供了早期AD诊断和向治疗的潜力.
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