在12种癌症类型中对m6A蛋白质组的系统性表征:多种蛋白质组集成研究
Hongru Li1, Yunke Jiang1, Jiajin Chen1,2
1Department of Biostatistics, Center for Global Health, School of Public Health, Nanjing Medical University, Nanjing 211166, China. sshen@njmu.edu.cn.
Molecular omics
|November 9, 2023
概括
这项研究揭示了蛋白质中的N6-甲基氨酸 (m6A) 修饰模式与癌症有关. 鉴定到的m6A蛋白质签名影响患者的生存和免疫反应,为癌症机制提供了新的见解.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- N6-甲基氨酸 (m6A) 调节剂及其相互作用的基因在癌症发育中起作用.
- 对于m6A修饰模式对人类蛋白质组学的影响尚不清楚.
研究的目的:
- 在泛癌样本中研究m6A修饰蛋白质组学模式的分子特征和临床意义.
- 为识别m6A标蛋白和评估其临床相关性开发一个多omics签名.
主要方法:
- 在CPTAC的1013个泛癌样本中分析m6A蛋白表达和分子特征.
- 整合m6A调节器和RNA的转录组学数据.
- 开发一个m6A多omics签名.
- 对已识别的蛋白质进行途径丰富分析.
主要成果:
- 超过一半的m6A蛋白在具有瘤特征的瘤组织中表达更高.
- 在9种癌症类型,瘤突变负担和免疫检查点 (PD-L1,PD-1) 中,m6A多基因特征与整体存活率有显著的相关性.
- 51种新型蛋白与这种特征有关,包括CHORDC1,它在瘤中升高调节,并且与七种癌症类型的预后较差有关.
结论:
- m6A修饰蛋白质组学模式在癌中具有显著的临床意义.
- 开发的m6A多组体特征可以识别潜在的m6A标蛋白并预测临床结果.
- 已识别的m6A点蛋白,如CHORDC1,可以提供有关癌症分子机制和治疗策略的见解.
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