开放科学发现有力的非对应性SARS-CoV-2主要蛋白酶抑制剂
Melissa L Boby1,2,3, Daren Fearon4,5, Matteo Ferla6
1Pharmacology Graduate Program, Weill Cornell Graduate School of Medical Sciences, New York, NY 10065, USA.
概括
COVID Moonshot 运动发现了一种新型的,非性SARS-CoV-2 主蛋白酶抑制剂. 这项开放科学的努力产生了大量数据,以加速未来的冠状病毒药物发现.
科学领域:
- 药物发现
- 结构生物学
- 计算化学
背景情况:
- 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 主蛋白酶是抗病毒药物开发的关键目标.
- 现有的抑制剂可能面临抗药性或特异性的挑战.
研究的目的:
- 使用开放科学,众筹方法识别SARS-CoV-2主要蛋白酶的新型非抑制剂.
- 为未来的冠状病毒药物发现工作创建一个全面的,公开可访问的知识库.
主要方法:
- 借助众包,机器学习,超大规模分子模拟以及高通量结构生物学和化学.
- 创造了超过18000种化合物设计, 并合成了超过2400种化合物.
- 收集了大量的结构数据 (490多个X射线结构) 和生物化学测试数据 (10,000多个测量).
主要成果:
- 发现了一种具有性特性的新型非共价,非性抑制剂支架.
- 绘制了SARS-CoV-2主要蛋白酶的结构可塑性.
- 为多种化学类型建立了广泛的结构-活性关系.
结论:
- COVID Moonshot 成功发现了一个有前途的抑制剂架构,并产生了丰富的开放数据集.
- 开放科学,众包模式加速了药物发现,并为抗击冠状病毒提供了宝贵的资源.
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