从小鼠外皮皮质脂肪组织中分离起始细胞和测序图书馆的构建
Qianglin Liu1, Chaoyang Li1, Yuxia Li1
1School of Animal Sciences, AgCenter, Louisiana State University, Baton Rouge, LA, USA.
STAR protocols
|November 10, 2023
概括
这项研究详细介绍了一种新方案,用于从小鼠内脏脂肪组织中分离原始细胞. 该方法可以构建RNA测序和ATAC-seq库,用于进一步研究.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 脂肪组织的原始细胞在新陈代谢调节和组织平衡中起着至关重要的作用.
- 有效的分离和这些细胞的分子特征对于理解它们的功能至关重要.
- 现有的协议可能在产量或下游分析的适用性方面存在限制.
研究的目的:
- 提出一种标准化的协议,用于从小鼠外皮膜内脏脂肪组织中分离原始细胞.
- 描述大量RNA测序和转移酶可访问染色体测试与测序 (ATAC-seq) 库的后续构建.
- 提供一种可复制的方法,适用于其他具有潜在修改的组织.
主要方法:
- 从小鼠上皮层脂肪收集脂肪组织.
- 细胞悬浮的酶消化和机械破坏.
- 细胞染色和光激活细胞分类 (FACS) 用于祖细胞丰富.
- 图书馆准备大量RNA测序和ATAC-seq.
主要成果:
- 成功地从小鼠外皮膜内脏脂肪组织中分离出可活的原始细胞.
- 产生适合测序的高质量的DNA和RNA.
- 证明该协议的适应性,用于构建RNA-seq和ATAC-seq库.
结论:
- 本协议提供了一种强大的方法,用于从脂肪组织中分离原始细胞和制备多原子库.
- 这种技术有助于对脂肪组织原生细胞进行全面的分子分析.
- 该协议的多功能性使其可用于涉及细胞类型特定分析的各种研究环境.


