在HRAM-LC-MS/MS期间使用MetaBolomics ID工作流程与中性损失检测自动识别修改核化物
Robert L Ross1, Ningxi Yu2, Ruoxia Zhao2
1Thermo Fisher Scientific, Lexington, Massachusetts 04241, United States.
Journal of the American Society for Mass Spectrometry
|November 10, 2023
概括
本研究介绍了一种自动化工作流程,用于使用液体染色学-并联质谱法 (LC-MS/MS) 识别改性核酸. 该方法能够对多个样本进行快速,准确的分析,改善生物研究中的核酸量化.
科学领域:
- 生物化学和分子生物学
- 分析化学 分析化学
- 代谢学 代谢学 代谢学
背景情况:
- 转录后的修改在生物过程中至关重要.
- 液体染色学 (LC) 和质谱学 (MS) 的进步增强了改性核酸盐分析.
- 现有的数据处理工作流与修改核酸的高吞吐量分析作斗争.
研究的目的:
- 开发一个强大的,自动化的工作流程,用于从批量LC-MS/MS数据中分析改性核化物.
- 为了提高生物样本中改性核酸标识和定量化的效率和准确性.
主要方法:
- 适应的Thermo Fisher科学化合物发现器软件用于自动核酸标识.
- 使用精确的质量,与图书馆进行光谱匹配,并用于确认中性损失识别.
- 将工作流应用于一批24个尿核酸样本.
主要成果:
- 成功识别并相对量化了16种已知的修饰核酸.
- 对于一批24个样本,在1小时内实现了准确的识别.
- 证明了自动化工作流对于高通量LC-MS/MS分析的实用性.
结论:
- 开发的自动化工作流程显著提高了对改性核酸的分析.
- 这种方法可以提高LC-MS/MS数据批处理的效率.
- 工作流程有助于更全面地研究生物系统中的改性核化物.
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