对内布拉斯加大学复制循环选择计划的基因组分析
Collin M Lamkey1,2, Aaron J Lorenz3,4
1Department of Agronomy and Horticulture, University of Nebraska, Lincoln, NE, 68583, USA.
概括
在玉米育种中,相互全兄弟 (RFS) 选择揭示了并行选择特征,特别是在染色体7上. 这表明适应可能通过软扫描模型利用现有的遗传变异.
科学领域:
- 植物育种 植物育种
- 遗传学 是一个遗传学.
- 进化生物学是进化的生物学.
背景情况:
- 玉米育种的近亲杂交系统反映了互惠的全兄弟 (RFS) 选择.
- 了解RFS选择影响遗传变异,选择,漂移和适应.
- 尼布拉斯加大学林肯分校的复制循环选择 (UNL-RpRS) 计划为研究基因组变化提供了一个强大的模型.
研究的目的:
- 在八个RFS选择周期后,确定正在选择的基因组区域.
- 评估选择对全基因组和局部人口结构的影响.
主要方法:
- 利用了来自UNL-RpRS计划中个体的密集基因型分序数据.
- 分析了八个循环复制的RFS和S1-后代选择数据.
主要成果:
- 在独立的选择程序中检测到平行选择签名,在染色体7上有一个值得注意的区域.
- 确定了可能通过常态遗传变异适应的区域,支持软扫描模型.
- 在RFS中发现了有限的证据,证明了在RFS中选择强烈分歧的种群.
结论:
- 并行选择特征表明,适应是利用常存的遗传变异来实现的.
- RFS选择可能不是强大的人口差异的主要驱动因素.
- 需要进一步的研究来探索影响RFS程序适应的因素.


