综合性单细胞元分析揭示了人类动脉样硬化的疾病相关的血管细胞状态和标记物
Jose Verdezoto Mosquera1, Gaëlle Auguste2, Doris Wong1
1Department of Biochemistry and Molecular Genetics, University of Virginia, Charlottesville, VA 22908, USA; Center for Public Health Genomics, University of Virginia, Charlottesville, VA 22908, USA.
Cell reports
|November 11, 2023
概括
这项研究使用单细胞数据绘制人体动脉样硬化图,揭示调制光滑肌细胞 (SMC) 是冠状动脉疾病 (CAD) 的关键. 新的标记物识别疾病进展,帮助心血管疾病研究.
科学领域:
- 心血管生物学 心血管生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 冠状动脉疾病 (CAD) 涉及由细胞相互作用驱动的斑块积累.
- 了解动脉样硬化的人类细胞表型至关重要,但具有挑战性.
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 提供了详细的细胞洞察力.
研究的目的:
- 创建人类动脉样硬化的综合细胞地图.
- 为了研究平滑肌肉细胞 (SMC) 在CAD中的调制作用.
- 为了确定动脉样硬化进展的新型标志物.
主要方法:
- 对22个scRNA-seq库 (118,578个细胞) 的综合元分析.
- 对细胞类型多样性,通信和SMC表型的分析.
- 与全基因组关联研究 (GWAS) 数据的整合.
- 使用omics和空间成像验证已识别的标记.
主要成果:
- 生成了人类动脉样硬化细胞景观的高分辨率地图.
- 确定调节的SMC表型在CAD,心肌梗塞和冠状动脉化中具有关键作用.
- 发现LTBP1和CRTAC1是纤维肌细胞/纤维体性SMC标志物,表明动脉样硬化进展.
结论:
- 开发的地图集为人类动脉样硬化提供了一个统一的观点.
- 调制的SMC是CAD病变发生的一个重要因素.
- 已识别的标记物为机械和转化性心血管疾病研究提供了潜力.
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