开发一种基于TaqMan探针的强大的单步多重RT-qPCR,用于同时检测SARS-CoV-2和流感A/B病毒
Hamidreza Abbasi1, Hadi Razavi Nikoo2,3, Fatemeh Fotouhi4
1Department of Medical Biotechnology, Faculty of Advanced Medical Technologies, Golestan University of Medical Sciences, Gorgan, Iran.
BMC microbiology
|November 11, 2023
概括
一种新的多重RT-qPCR测定准确检测SARS-CoV-2,流感A和流感B. 这种快速诊断工具对于在流感季节区分感染至关重要,确保及时治疗患者.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子诊断学 分子诊断
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 同时检测SARS-CoV-2,流感A和流感B对于差异诊断至关重要,特别是在流行后流感季节的联合循环期间.
- 由于SARS-CoV-2基因组突变和变种的出现,现有的多重诊断方法需要更新.
研究的目的:
- 开发和验证一种新型,高度敏感和特定的多重RT-qPCR试验,用于同时检测SARS-CoV-2,A型流感和B型流感.
- 识别SARS-CoV-2 N基因中的保存区域,以改进原料和探针设计,提高对新兴变异的测试性能.
主要方法:
- 基因组调查以确定保存的SARS-CoV-2 N基因区域,用于初始和探针设计.
- 开发和分析验证多重RT-qPCR试验,包括确定95%的检测下限 (LLOD).
- 使用70个样本进行临床性能评估,通过统计协议分析将新型试验与商业多重组件进行比较.
主要成果:
- 新型多重RT-qPCR试验表现出高分析和临床性能,检测出所有令人担忧和感兴趣的SARS-CoV-2变种.
- 95%的LLOD是20个副本/反应 (SARS-CoV-2 N基因),2个副本/反应 (流感A M1基因) 和2个副本/反应 (流感B NS1基因).
- 诊断灵敏度为94.4% (SARS-CoV-2),93.7% (流感A) 和100% (流感B),所有目标的特异性为100%. 与商业套件的协议在统计学上是微不足道的.
结论:
- 一种新的内部多重RT-qPCR测定方法为诊断SARS-CoV-2,流感A和流感B感染提供了高灵敏度,特异性和可靠性.
- 这种测定在流感季节的临床环境中是有价值的,使得成本效益,时间效率和准确的患者管理成为可能.
- 开发的试验为差异诊断提供了一个可靠的工具,对于及时和具体的治疗决定至关重要.
