基于尺寸排除色谱的并联策略对等离子体外丰富和蛋白质组分析进行比较

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 细胞外囊泡 细胞外囊泡

背景情况:

• 从人体等离子体中对外体的蛋白质组分析是具有挑战性的,因为外体丰富度低和复杂的等离子体矩阵.
• 外体丰富对于准确和深入的蛋白质组研究至关重要.
• 尺寸排除色谱 (SEC) 是一种常见的外体隔离方法,用于提高纯度,开发了各种合方法.

研究的目的:

• 系统地评估和比较基于SEC的不同人体血外体隔离方法.
• 评估直接SEC,SEC-超离心 (SEC-UC),SEC-超过 (SEC-UF) 和SEC-二氧化微球 (SEC-TiO2) 的效率,用于蛋白质组分析.
• 在蛋白质组研究中确定用于标准化等离子体外体隔离的最有效方法.

主要方法:

• 从人体血中对四种外体隔离方法进行比较分析:直接SEC,SEC-UC,SEC-UF和SEC-TiO2.
• 评估每个方法的外体纯度和蛋白质组分析准确度.
• 评估蛋白质识别号码,并与已知的外体细胞标记物重叠.

主要成果:

• 与直接的SEC相比,基于SEC的合方法显著提高了外体纯度.
• SEC-UC产生了最高数量的已识别的蛋白质,以及与顶部外基因组标记物最大的重叠.
• SEC-TiO2证明了最有效的去除污染的血蛋白质.

结论:

• 基于SEC的合方法优于直接SEC,用于从人体血中分离高度纯净的外体,用于蛋白质组分析.
• 建议使用SEC-UC方法来最大限度地识别蛋白质和恢复外体标记.
• 对于广泛的血蛋白耗尽,SEC-TiO2方法是最佳的,增强了对外体的特定分析.