跨平台识别和验证状黑色素瘤玻璃蛋白生物标志物
Gabriel Velez1,2, Julian Wolf1,2, Antoine Dufour3
1Molecular Surgery Laboratory, Stanford University, Palo Alto, California, United States.
Investigative ophthalmology & visual science
|November 13, 2023
概括
对卵膜黑色素瘤 (UM) 玻璃体活检的蛋白质组分析发现了许多高调蛋白质,包括LYVE-1. 这种方法可以为UM提供预后见解和治疗目标.
科学领域:
- 眼科医生 眼科 眼科
- 在瘤学瘤学.
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 卵巢黑色素瘤 (UM) 是最常见的初级眼内恶性瘤.
- 准确的预后生物标志物和治疗目标对于改善患者的治疗结果至关重要.
- 玻璃体是眼睛疾病中液体活检的潜在来源.
研究的目的:
- 在UM患者的玻璃组织活检中分析蛋白质表达.
- 确定预后生物标志物,信号通路和UM的治疗点.
- 将从质谱法获得的蛋白质表达数据与ELISA进行比较.
主要方法:
- 从UM患者 (n=8) 和对照人群 (n=3) 收集玻璃体活检.
- 样品使用液体染色学-并联质谱法 (LC-MS/MS) 进行分析.
- 蛋白质与来自目标多重ELISA蛋白质组学平台的数据进行了比较.
主要成果:
- 在UM玻璃体中检测到69种明显升高的蛋白质,包括LYVE-1.
- 通过LC-MS/MS识别出62种新型上调蛋白质,这些蛋白质以前没有被ELISA检测到.
- 特定的蛋白质 (例如,HGFR,PYGL,ENPP-2,NEO1,LRP1) 与瘤分子分类 (GEP,PRAME) 相相关.
- 胰岛素类生长因子 (IGF) 调节作用因子的比例很高 (P=1.74E-16).
结论:
- 液体活检的蛋白质组分析可以为UM提供预后信息.
- 使用多个蛋白质检测平台可以提高候选生物标记物检测灵敏度.
- 这项研究精确地描述了UM患者的玻璃体蛋白质组.
