多尺度光催化接近性标记揭示了细胞表面上的邻居以及细胞之间的邻居
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|November 14, 2023
概括
一种新的多尺度近距离标记蛋白质组学 (PLP) 方法使用Eosin Y染料在不同分辨率下绘制细胞表面的蛋白质邻居图. 这种技术分析了瘤性EGFR和细胞-细胞突触,有助于细胞表面相互作用构造和免疫疗法发现.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学
- 化学生物学 化学生物学
背景情况:
- 细胞膜蛋白质对细胞通信至关重要,但理解动态蛋白质邻居仍然具有挑战性.
- 目前的近距离标记蛋白质组学 (PLP) 方法提供单一分辨率的快照,限制了对蛋白质相互作用的全面分析.
研究的目的:
- 开发一种具有可调节分辨率的多尺度PLP方法,用于绘制细胞表面和细胞之间蛋白质邻近的地图.
- 描述瘤性表皮生长因子受体 (EGFR) 和细胞-细胞突触的蛋白质邻居.
主要方法:
- 开发了一个多尺度的PLP平台,使用可见光激活的Eosin Y染料来产生具有明显标记半径 (∼1003000 Å) 的三个光探头.
- 应用该平台来分析EGFR邻居和由BiTE和CAR T细胞诱导的细胞-细胞突触.
- 使用免疫试验和AlphaFold-Multimer预测验证的蛋白质邻居.
主要成果:
- 成功分析了EGFR的蛋白质邻居,并确定了20多个邻居.
- 在较长的长度尺度上绘制了由BiTE和CAR T细胞形成的细胞-细胞突触中的蛋白质相互作用.
- 为验证的邻居生成了可信的二进制相互作用模型.
结论:
- 集成的多尺度PLP平台能够全面地绘制细胞内和细胞间的局部和远端蛋白质网络.
- 这种方法有助于细胞表面相互作用的系统构建.
- 这些发现可能会揭示新的治疗机会,特别是在免疫治疗中.
