基于口的基因特征,用于预测三阴性乳腺癌新辅助化疗对新辅助化疗的反应
Mohamed Omar1,2, Pier Vitale Nuzzo3, Francesco Ravera3,4
1Department of Pathology and Laboratory Medicine, Weill Cornell Medicine, New York, NY, USA. mao4005@med.cornell.edu.
Journal of translational medicine
|November 15, 2023
概括
一个新的基因特征预测了三阴性乳腺癌 (TNBC) 中新辅助化疗 (NACT) 的反应. 该工具有助于识别可能从NACT中受益的患者,改善这种侵袭性癌症的治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 新辅助化疗 (NACT) 的疗效在三阴性乳腺癌 (TNBC) 中有所不同.
- 目前缺乏用于预测TNBC中NACT反应的生物标志物.
- 之前的基因表达分类器的临床效用有限.
研究的目的:
- 开发和验证一个强大的基因特征,用于预测TNBC患者对NACT的病理完整反应 (pCR).
- 为了提高准确性,确定一个结合生物约束的预测模型.
- 评估开发的无复发生存 (RFS) 签名的预后价值.
主要方法:
- 利用了298名TNBC患者的手术前转录基因资料.
- 训练了一种基于等级的分类器 (k-top分数对),专注于Notch信号通路基因.
- 在两个独立的队列 (75名和71名患者) 上验证了签名,并使用生存分析评估了RFS.
主要成果:
- 开发了一个五基因对签名,可对pCR进行强有力的预测 (AUC为0.76和0.85).
- 该签名在NACT响应预测方面表现优于现有的基因签名.
- 在独立的TNBC队列中与RFS显著相关,独立于临床因素.
结论:
- 引入了一种强大的基因特征,用于预测NACT接受的TNBC患者的pCR.
- 该签名使用可解释的,基于Notch通路基因的等级规则.
- 签名的预测和预后性能支持其在TNBC患者分层化中的临床实施潜力.
