滴滴数字PCR应用程序用于检测空气样本中的SARS-CoV-2

科学领域:

• 环境病毒学 环境病毒学
• 分子诊断学 分子诊断学
• 传染病传播 传染病传播

背景情况:

• 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 通过空气传播是一种担忧,特别是在通风不良的室内环境中.
• 由于病毒载量较低和当前分析方法的局限性,精确检测空气传播的SARS-CoV-2具有挑战性,往往导致假阴性.
• 缺乏确定空气传播病毒存在的标准化方法.

研究的目的:

• 评估使用滴滴数字聚合酶链反应 (ddPCR) 在空气样本中检测SARS-CoV-2核糖核酸 (RNA) 的可行性.
• 为了比较ddPCR与实时逆转录酶-聚合酶连锁反应 (RT-PCR) 的性能.
• 评估不同数字PCR平台 (QX200和QIAcuity) 与RT-PCR的可比性.

主要方法:

• 从2021年12月到2022年2月,在马来西亚的医院和隔离中心进行了主动和被动空气采样.
• 在空气样本中检测和量化了使用ddPCR和RT-PCR的SARS-CoV-2RNA.
• 负染色传输电子显微镜用于病毒超结构可视化.

主要成果:

• 与RT-PCR (3.4%) 相比,ddPCR在空气样本中显示了SARS-CoV-2 RNA的显著更高的检测率 (15.2%).
• ddPCR显示出100%的灵敏度和87%的特异性.
• 在ddPCR平台和RT-PCR之间的比较显示了变异性, ddPCR识别了RT-PCR遗漏的阳性样本.

结论:

• 滴滴数字PCR是一种精确和高度敏感的方法,用于检测空气样本中的SARS-CoV-2RNA.
• ddPCR可以改善空气中低病毒标位的检测,从而减少假阴性结果.
• 这种方法可以补充空气传播病毒的现有RT-PCR检测策略.