在CMV和ZIKV先天性感染中,ADAR RNA编辑模式的变化

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 神经科学是一个神经科学.
• 病毒学 病毒学

背景情况:

• 主要由作用于RNA的腺氨酸脱氨酶 (ADARs) 介导的RNA编辑使转录组多样化,对大脑功能和免疫反应至关重要.
• ADAR1,特别是p150异型,在病毒感染期间由干扰素诱导,在抗病毒免疫力中发挥作用.
• 病毒诱导的ADAR表达对宿主转录组编辑在先天性感染期间的影响,特别是在神经发育异常方面,仍未得到充分研究.

研究的目的:

• 在先天性病毒感染期间调查宿主转录组中ADAR表达和RNA编辑模式的变化.
• 为了检查人类细胞巨乳病毒 (HCMV) 和寨卡病毒 (ZIKV) 感染数据集中的ADAR表达.
• 评估改变的RNA编辑和先天性感染中的神经症状之间的潜在联系.

主要方法:

• 从HCMV,小鼠细胞巨乳病毒 (MCMV) 和ZIKV感染样本 (包括小鼠模型和人类诱导的多能神经产生细胞 - - hiNPCs) 获得的公开可用的微阵列和RNA-seq数据集的分析.
• 在感染和未感染样本中量化ADAR1表达水平.
• 评估RNA编辑速率和识别受感染样本中改变的编辑部位.

主要成果:

• 在所有三个数据集中,ADAR1在感染样本中始终过度表达.
• 在大多数感染的小鼠模型中,RNA编辑部位的数量显著增加,但在hiNPC ZIKV样本中没有.
• 在小鼠ZIKV感染中观察到关键神经基因 (例如,Gria3,Grik5,Nova1) 和潜在的miRNA结合部位的改变编辑.

结论:

• 先天性病毒感染诱导ADAR表达的变化和调节不良的主机RNA编辑.
• 关键神经基因中的编辑模式改变可能是与先天性感染相关的神经发育异常的基础.
• 需要进一步的研究,以阐明编辑变化的全谱及其在各种先天性感染中的功能后果.