一种基于DNA甲基化生物标志物和低剂量计算机断层扫描图像的新型多式预测模型,用于识别早期肺癌
Jing Zhang1, Haohua Yao2, Chunliu Lai1
1Division of Pulmonary and Critical Care Medicine, the First Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University, Guangzhou 510080, China.
Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
|November 16, 2023
概括
使用SHOX2/PTGER4基因的DNA甲基化,结节的外观和LDCT图像的新模型有效地将早期肺癌与良性结节区分开来. 这种多模式的方法显示出改善肺癌诊断和预后的希望.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 放射学 放射学是一门学科.
背景情况:
- DNA甲基化变化是肺癌发生的早期事件.
- 在肺癌中,SHOX2和PTGER4基因甲基化在免疫信号传递中起作用.
- 从良性肺结节区分早期的肺癌仍然是一个临床挑战.
研究的目的:
- 开发一种用于早期肺癌检测的多式预测模型.
- 为了利用低身高的homeobox 2基因 (SHOX2) 和前列腺素E受体4基因 (PTGER4) 在血中的DNA甲基化.
- 整合结节外观亚型和低剂量计算机断层扫描 (LDCT) 成像,以提高诊断准确度.
主要方法:
- 开发了一种多式预测模型,并对257个人进行了训练.
- 模型的性能在42名受试者的独立队列中得到了验证.
- 使用TCGA数据探索了SHOX2/PTGER4DNA甲基化和驱动基因突变之间的关联.
主要成果:
- 多式联运模型在验证组中实现了0.894的AUC,超过了现有模型.
- 在早期肺癌和良性群体之间观察到甲基化水平的显著差异.
- 在肺癌患者中,SHOX2/PTGER4DNA高甲基化与TP53突变有关.
结论:
- 开发的多式预测模型有效地区分了早期的肺癌和良性肺结节.
- 这种模型为早期肺癌诊断提供了潜在的进步.
- 结合DNA甲基化和驱动基因改变的预后指数可能会根据预后对患者进行分层.
