一种灵敏而简单的RT-LAMP试验,用于对蝙蝠进行沙贝科病毒查
Tony Tat-Yin Chan1, Franklin Wang-Ngai Chow1,2, Joshua Fung1,2
1Department of Microbiology, Li Ka Shing Faculty of Medicine, The University of Hong Kong , Hong Kong, China.
Microbiology spectrum
|November 16, 2023
概括
一种新的色度和光反转录循环介导同热放大 (RT-LAMP) 试验使得蝙蝠中sarbecoviruses的有效群体查成为可能. 这种简单,可扩展的方法为改善冠状病毒监测提供了与qRT-PCR相似的灵敏度和特异性.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子生物学分子生物学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 冠状病毒,特别是sarbecoviruses,对动物传染性溢出构成重大威胁.
- 对蝙蝠种群的有效监测对于早期发现新出现的病毒威胁至关重要.
- 现有的诊断方法对于大规模的现场查可能是资源密集的.
研究的目的:
- 开发和评估一种新的色度和光反转录循环介导同热放大 (RT-LAMP) 试验,用于大规模查蝙蝠中的沙贝科病毒.
- 根据已建立的定量逆转录PCR (qRT-PCR) 方法来评估试验的性能.
- 为了突出测试对蝙蝠传播的冠状病毒的实地监测的实用性.
主要方法:
- 开发一种色度和光RT-LAMP测定方法.
- 测试的评估使用了来自蝙蝠的838个口腔和食样本.
- 将RT-LAMP测定灵敏度和特异性与qRT-PCR进行比较.
- 包括SYTO9光核酸染料用于定量分析.
主要成果:
- 在RT-LAMP试验中,QRT-PCR的灵敏度和特异性与QRT-LAMP相似.
- 该试验提供了一种简单且可扩展的方法来检测沙贝科病毒.
- 通过添加SYTO9.9可以实现定量分析.
结论:
- 开发的RT-LAMP检测方法是大规模查蝙蝠沙贝科病毒的一个有价值的工具.
- 它的简单性和可扩展性提高了检测新出现的冠状病毒的准备.
- 该试验适用于实地研究和持续监测计划.
