用于数据独立获取的提取窗口对在可疑查期间对特征注释的影响
Bastian Schulze1, Amy L Heffernan1, Maria Jose Gomez Ramos2
1The University of Queensland, Queensland Alliance for Environmental Health Sciences (QAEHS), 20 Cornwall Street, Woolloongabba, QLD, 4102, Australia.
Chemosphere
|November 16, 2023
概括
优化数据独立采集 (DIA) 设置,如所有理论质谱 (SWATH-MS) 的顺序窗口采集,对于准确的非目标分析 (NTA) 至关重要. 采集窗口的理想数量取决于可靠的化学识别的样本矩阵.
科学领域:
- 环境化学环境化学
- 分析化学是一种分析化学.
- 质谱测量质量谱测量
背景情况:
- 使用高分辨率质谱的非目标分析 (NTA) 对于识别未知的化学物质至关重要.
- 数据独立获取 (DIA),如SWATH-MS,对于全面的NTA至关重要.
- 在DIA方法中的获取参数可以显著影响化学特征的检测和注释.
研究的目的:
- 评估不同DIA设置如何影响化学特征的自信注释和识别.
- 评估采购窗口数量和规模对NTA在各种样本矩阵中的影响.
- 确定特定于矩阵的最佳 DIA 参数,以改进化学选.
主要方法:
- 环境 (河水,PSE),废水和生物 (尿液) 样本的分析.
- 使用了11种不同的顺序窗口获取所有理论质谱 (SWATH-MS) 方法,具有5-15个可变的获取窗口.
- 评估了真正正的注释率,注释的特征数量和图书馆得分变化.
主要成果:
- 真正阳性注释率因矩阵而异,在使用更多窗口的尿液和废水中观察到的比率更高 (15).
- 在具有特定窗口计数的PSE和尿液中,注释特征的数量最大化 (分别为9和14).
- 较不复杂的矩阵显示出更高的注释率与更少的窗口 (5-6),表明矩阵依赖的最佳设置.
结论:
- 优化DIA参数,特别是获取窗口的数量,对于有效的非目标分析至关重要和依赖于矩阵.
- 图书馆分数的变化需要精心策划的图书馆和优化方法,以可靠地进行化学识别.
- 实现最佳的总和真正的正值注释的比率是成功的NTA结果的关键.
