肠道微生物的结构变异与免疫检查点抑制剂反应有关
Rong Liu1,2,3,4, You Zou5, Wei-Quan Wang6,7,8,9
1Department of Clinical Pharmacology, Xiangya Hospital, Central South University, 87 Xiangya Road, Changsha, 410008, P. R. China. liuronghyw@csu.edu.cn.
Nature communications
|November 17, 2023
概括
肠道细菌的基因组变异影响免疫检查点抑制剂 (ICI) 的有效性和毒性. 识别这些微生物结构变异 (SV) 为癌症免疫治疗结果提供了新的见解.
科学领域:
- 微生物组研究的研究.
- 基因组学就是基因组学.
- 癌症免疫疗法癌症免疫疗法
背景情况:
- 肠道微生物群在免疫检查点抑制剂 (ICI) 的治疗耐药性和毒性中的作用得到了认可.
- 肠道细菌内的基因组变异对ICI疗效的影响在很大程度上仍未被探索.
- 细微的细菌菌株基因组差异可以导致显著的表型变化.
研究的目的:
- 系统地识别肠道微生物组中的微生物基因组结构变异 (SV).
- 调查已识别的SVs与ICI治疗中的患者结果之间的关联.
- 探索SVs,治疗反应,生存和免疫相关不良事件之间的联系.
主要方法:
- 利用了来自七项临床试验的996名患者的肠道微生物组数据.
- 使用SGV-Finder系统识别微生物基因组结构变异 (SV).
- 进行了全基因组的关联分析,以探索与临床终点的 SV 关联.
- 在不同患者队伍中重复发现.
主要成果:
- 确定了与响应,无进展生存率和整体生存率相关的特定微生物SV.
- 发现了SV和免疫相关不良事件之间的关联.
- 在关键物种中检测到相关的SVs,例如*Akkermansia muciniphila*,*Dorea formicigenerans*和*Bacteroides caccae*.
- 编码葡萄糖代谢酶的基因位于与 SV 相关的区域.
结论:
- 发现了一种新的肠道微生物组基因组异质性的新层,影响ICI治疗预后.
- 在癌症免疫治疗中证明了微生物SV和宿主结果之间的相关性.
- 对肠道微生物群和瘤免疫治疗之间的复杂相互作用的先进理解.
