在单个小鼠卵细胞中同时进行深度转录组和蛋白质组分析
Yi-Rong Jiang1, Le Zhu2, Lan-Rui Cao2
1Institute of Microanalytical Systems, Department of Chemistry, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China.
Cell reports
|November 17, 2023
概括
一个新的平台可以同时进行单细胞转录组和蛋白质组分析. 这一突破为基因和蛋白质表达提供了深入的洞察力,有助于研究细胞过程,如卵细胞半转化.
科学领域:
- 单细胞生物学 单细胞生物学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学和蛋白质组学
背景情况:
- 在单细胞水平上同时进行转录组和蛋白质组分析带来了重大的技术挑战.
- 了解转录和翻译之间的关系对于细胞功能至关重要.
研究的目的:
- 开发和验证一个新的平台,对单细胞转录组和蛋白质组进行深入,联合的定量分析.
- 为了研究转录蛋白相关性和单个小鼠卵细胞中的半变调节网络.
主要方法:
- 开发一个单细胞同时转录和蛋白质组 (scSTAP) 分析平台.
- 微流体学,高通量测序和质谱学的整合.
- 在介质成熟过程中分析单个小鼠卵细胞的应用.
主要成果:
- 每个小鼠卵细胞中平均量化了19948个基因和2663个蛋白质组.
- 能够深入分析单个RNA-蛋白对相关性和半变调节网络.
- 确定了30个特定的转录蛋白对作为卵细胞成熟的签名.
结论:
- scSTAP平台为单细胞水平的联合转录组和蛋白质组分析提供了强大的资源.
- 这些发现提供了对卵细胞化过程中的转录和转化调节的新见解.
- 识别的签名可以促进细胞分化和调节机制的研究.
