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Updated: Jul 11, 2025

Simple and Rapid Method to Obtain High-quality Tumor DNA from Clinical-pathological Specimens Using Touch Imprint Cytology

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Published on: March 21, 2018

在常规操作期间直接采样改善了脑瘤遗传分析样本中的核酸质量:一项回顾性研究

Yuri Noda¹, Tomofumi Sakagami², Kensuke Suzuki²

¹Department of Pathology and Laboratory Medicine, Kansai Medical University Hospital, 2-3-1 Shin-machi, Hirakata, Osaka 573-1191, Japan; Department of Pathology, Kansai Medical University, 2-5-1 Shin-machi, Hirakata, Osaka 573-1010, Japan.

Pathology, research and practice

|November 17, 2023

概括

采集头部和部状细胞癌 (HNSCC) 样本的新方法,称为遗传分析样本 (GAS),比传统方法更好地保持核酸完整性. 这提高了HNSCC患者个性化医疗的选择.

科学领域:

在瘤学瘤学.
分子生物学分子生物学
遗传学是一个遗传学.

背景情况:

由于核酸完整性差和样本材料有限,头状细胞癌 (HNSCC) 对遗传分析提出了挑战.
对HNSCC有效的个性化药物需要改进的方法来获得高质量的遗传物质.

研究的目的:

为了评估一种新的采样方法,基因分析样本 (GASs),以保持HNSCC中的核酸完整性.
用于基因分析,将GAS中的核酸质量与其他样本类型 (初级瘤,脱瘤,淋巴结转移,近化成分) 的质量进行比较.

主要方法:

从44名患者中收集了128个HNSCC样本,包括GAS (快速固定在甲中的5mm3碎片),初级瘤,脱瘤,淋巴结转移和帕卡拉蒂尼化组件.
通过使用DNA完整数 (DIN),RNA完整数 (RIN) 和RNA片段百分比>200核酸 (DV200) 来评估核酸质量.
进行下一代测序 (NGS) 来评估基因分析的适用性.

主要成果:

与其他组相比,GASs的DNA完整性和RNA片段百分比明显更高.
RNA完整性按以下顺序下降:淋巴结,GAS,原发性瘤和脱的瘤.
在近化成分,原发性瘤和淋巴结之间没有发现核酸质量指标的显著差异.

结论:

在常规程序中收集的基因分析样本 (GAS) 为HNSCC基因分析提供了优越的核酸保存.
当可活组织受到限制时,可活性成分是HNSCC.遗传分析的可行的替代方案.

关键词:

的DNA完整性号码.脱过程中的脱.头部和部状细胞癌瘤这是下一代测序.RNA完整性数字是RNA完整性数字.样品质量样品质量样品质量

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