骨质疏松症中的Th17细胞相关基因生物标志物:综合生物信息学分析和体内验证
Jianxing Chen1, Qifeng Sun1, Wenzhe Yin1
1Department of Joint Surgery, Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, China.
Hormone and metabolic research = Hormon- und Stoffwechselforschung = Hormones et metabolisme
|November 17, 2023
概括
这项研究揭示了与骨质疏松症中T辅助17 (Th17) 细胞相关的关键基因. 识别这些差异表达的基因为骨免疫相互作用和骨质疏松症的潜在生物标志物提供了洞察力.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 骨生物学 骨生物学 骨生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 骨和免疫系统之间的相互作用对于骨质疏松症的调节至关重要.
- 在骨质疏松病原发生中,T辅助17 (Th17) 细胞及其相关基因的特定作用需要进一步阐明.
研究的目的:
- 确定和描述与骨质疏松症相关的T辅助17 (Th17) 细胞相关基因 (DETh17RGs).
- 探索Th17细胞介导骨质疏松症中涉及的功能意义和潜在的枢纽基因.
主要方法:
- 使用了来自基因表达综合 (GEO) 数据库的GSE35959数据集.
- 使用ImmuCellAI进行免疫细胞丰度分析,对DETh17RGs进行差异和相关性分析.
- 应用基因本体学 (GO),基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 路径丰富,权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 和用于枢纽基因识别的CytoHubba.
- 在小鼠模型中使用额外的数据集和定量PCR (qPCR) 验证了枢纽基因表达.
主要成果:
- 确定了464个DETh17RG,其中421个与骨质疏松症有关,43个与骨质疏松症有关.
- 发现了七个中心DETh17RG:CD44,TGFB1,ACTN4,ARHGDIA,ESR1,TLN1和FLNA.
- 在生物信息学分析和小鼠模型中观察到枢纽基因的一致表达趋势.
结论:
- 提供了涉及Th17细胞在骨质疏松症发展中的分子机制的全面理解.
- 突出了骨质疏松症诊断的潜在新生物标志物和针对Th17细胞的治疗策略.
