基于Fucoidan的无抗体磁纳米粒子用于现场检测水传播的SARS-CoV-2
Jinhui Zhu1, Huijun Lu1, Qiuyuan Lin2
1Shanghai Key Laboratory of Atmospheric Particle Pollution and Prevention (LAP3), Department of Environmental Science & Engineering, Fudan University, Shanghai 200438, China.
The Science of the total environment
|November 17, 2023
概括
一种新方法使用含有富可伊丹和多多巴胺的磁珠 (Fuc-PDA-MBs) 来捕获环境水中的SARS-CoV-2. 这种方法可以为公共卫生监测和预警系统提供快速,灵敏的检测.
科学领域:
- 环境科学 环境科学
- 生物技术是生物技术.
- 病毒学 病毒学
背景情况:
- 照顾点测试 (POCT) 对于检测SARS-CoV-2至关重要,但由于复杂的破坏因素,环境水样带来了挑战.
- 现有的方法在现实世界水矩阵中难以检测微量病原体,因此需要改进样本预处理策略.
研究的目的:
- 开发和验证一种基于磁珠的新型捕获载体 (Fuc-PDA-MBs) 来有效地从环境水中丰富SARS-CoV-2.
- 将这种捕获方法与无核酸提取的循环介导同热放大 (LAMP) 试验相结合,以快速检测POCT.
主要方法:
- 用富可伊丹和聚多巴胺 (Fuc-PDA-MBs) 涂覆的磁珠被合成用于捕获SARS-CoV-2尖端 (S1) 蛋白质受体结合域 (S1 RBD).
- Fuc-PDA-MBs方法使用环境水中添加SARS-CoV-2尖端伪病毒进行了测试,并与原始污染的城市废水进行了验证.
- 开发了一种集成的Fuc-PDA-MBs-LAMP测定方法,绕过核酸提取以进行简化和快速检测.
主要成果:
- Fuc-PDA-MBs在度范围为10^7.62到10^4.34基因拷贝/L.L.之间显示了SARS-CoV-2尖峰伪病毒的平均76%捕获效率.
- 与电子阴性过 (ENF) 相比,Fuc-PDA-MBs方法显示出更高的病毒吸附效率,并实现了废水中SARS-CoV-2变种的高恢复率.
- 在Fuc-PDA-MBs-LAMP试验中,获得了10^5.49基因拷贝/L的量化极限 (LOQ),整个过程在90分钟内完成.
结论:
- Fuc-PDA-MBs-LAMP试验提供了一种广泛,经济和快速的POCT解决方案,用于检测复杂的环境样本中的SARS-CoV-2突变体.
- 这种综合系统可适应高通量测试,并有可能在现场对SARS-CoV-2疫情进行早期预警,特别是在发展中国家.
- 作为抗体替代品的fucoidan的使用为病毒丰富提供了一个强大的和具有成本效益的方法.
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