在全基因组复制事件之后,CK1δ/ε基因酶诺基的并行非功能化
Daniel Evans-Yamamoto1,2,3,4,5,6,7, Alexandre K Dubé1,2,3,4,5, Gourav Saha1,2,3,4,5,8
1Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec, QC, G1V 0A6, Canada.
在酵母中,全基因组复制 (WGD) 导致HRR25基因对. 大多数对显示功能逐渐丧失,其中一个副本变得不必要并迅速演变,表明非功能化而不是子功能化.
科学领域:
- 进化生物学是进化的生物学.
- 基因组学就是基因组学.
- 酵母遗传学 酵母遗传学
背景情况:
- 整个基因组复制 (WGD) 事件创造了ohnolog对,为平行基因进化提供了洞察力.
- 在Saccharomycetaceae酵母中的HRR25基因是维护WGD后的ohnolog对的罕见例子.
- 在Saccharomyces cerevisiae中,HRR25是必不可少的,并编码素激酶1δ/ε,参与各种细胞功能.
研究的目的:
- 为了研究假设重复HRR25的ohnologs通过子功能化来维持.
- 功能性地评估HRR25的演化轨迹 ohnologs跨Saccharomycetaceae的物种.
主要方法:
- 使用Saccharomyces cerevisiae作为模型系统的功能补充分析.
- 对25个HRR25的 ортолог进行比较分析,包括7个WGD后的onnolog对.
- 评估蛋白质演化速率,蛋白质与蛋白质相互作用 (PPI) 和细胞局部化.
主要成果:
- 没有观察到对依赖补充支持子功能化的证据.
- 大多数后WGD HRR25的ohnologs未能补充,表明非功能化或新功能化.
- 非补充的ohnologs表现出加速的蛋白质进化,减少的PPI和改变的细胞局部,表明功能下降.
结论:
- 在Saccharomycetaceae中的HRR25基因家族正在经历WGD后的ohnologs的逐渐非功能化.
- 与亚功能化相反,HRR25的一个副本似乎正在失去功能,并在一些物种中变得不必要.
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