异常的生物标志物预测复杂的FAS或FADD缺陷被外基因组测序遗漏
Anne Rensing-Ehl1, Myriam Ricarda Lorenz2, Marita Führer3
1Institute for Immunodeficiency, Center for Chronic Immunodeficiency (CCI), Medical Center - University of Freiburg, Faculty of Medicine, University of Freiburg, Freiburg, Germany.
The Journal of allergy and clinical immunology
|November 18, 2023
概括
复杂的FAS基因和FAS通路基因的复杂遗传变化解释了自身免疫淋巴增殖综合征 (ALPS) 病例被标准测序遗漏. 生物标志物和双阴性T细胞 (DNT) 现型识别准确地识别这些ALPS患者.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 遗传学 是一个
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 自免疫淋巴增殖综合征 (ALPS) 经常通过增加的双阴性T细胞 (DNT) 和血清生物标志物来识别.
- 标准的外基因组测序无法检测一些ALPS患者的FAS突变,称为ALPS-未确定 (ALPS-U).
研究的目的:
- 在ALPS-U患者中调查FAS基因和相关FAS通路基因的复杂遗传变异.
- 确定这些变化是否解释了标准测序无法识别的ALPS病例.
主要方法:
- 整个FAS基因测序,复制数变异分析和FAScDNA测序.
- 测序其他与FAS通路相关的基因.
- 在CD57+ DNT上进行FAS表达分析,以预测体质异性损失 (sLOH).
主要成果:
- 在16名ALPS-U患者中,有9名患者在DNT上显示FAS表达的减少,这表明FAS异合突变与获得的体质第二次命中.
- 七名患者在FAS中出现了深度内突变或大缺失,其中一名患有FAS外因子重复.
- 三名患者患有FAS促进器突变;三名患有FADD突变与sLOH.
结论:
- 复杂的FAS和FADD遗传变异,包括深层内突变和促进体变异,有助于ALPS-U.
- 将血清生物标志物和DNT表型结合起来对于诊断ALPS患者的诊断至关重要,因为常规的外体序列测序错过了这一点.
