基于qPCR的表观遗传免疫细胞量化规范
Konstantin Schildknecht1, Björn Samans1, Jasmin Gussmann1
1Ivana Türbachova Laboratory for Epigenetics, Epiontis, Precision for Medicine GmbH, Berlin, Germany.
Clinical chemistry and laboratory medicine
|November 20, 2023
概括
表观遗传定量PCR (qPCR) 提供了一种标准化,稳定和精确的免疫细胞计数方法,在诊断和临床试验的免疫监测中表现优于传统的流细胞计. 这种技术使得可靠的个人参考间隔,检测大约50%的变化显著的变化.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 分子生物学分子生物学
- 临床诊断 临床诊断 临床诊断
背景情况:
- 免疫监测对免疫功能低下的患者至关重要,但如流细胞计等现有方法面临标准化挑战和后勤需求.
- 有限的样本可用性需要基于人口的参考间隔,阻碍了个性化诊断.
- 表观遗传定量PCR (qPCR) 成为一种可行的替代方案,具有广泛的适用性和最小的后勤要求.
研究的目的:
- 描述表观性qPCR试验的分析性能规范 (APS),用于定量免疫细胞群 (CD3 +,CD4 +,CD8 + T细胞,B细胞,NK细胞).
- 评估表观基因qPCR在临床试验和诊断中的免疫监测的适用性,考虑到监管要求.
- 评估从表观基因qPCR数据中得出的个别参考间隔的诊断效用.
主要方法:
- 开发了基于qPCR的五种表观遗传分析,并根据分析性能的监管指南进行验证,包括偏差,可变性,线性,性和样本稳定性.
- 经过验证的测定方法应用于28天内从25名健康捐献者的毛细血管血液样本.
- 个人性指数 (IoI) 和参考变化值 (RCV) 被计算出来,以评估个别参考区间的诊断潜力.
主要成果:
- 表观基因qPCR试验符合所有定义的分析性能规范,显示出高精度,稳定性和可靠性.
- 试验成功量化了CD3+,CD4+,CD8+T细胞,B细胞和NK细胞.
- 对IOI的分析表明,个人参考区间比以人口为基础的参考区间具有优势. RCVs表明,细胞计数大约50%的变化意味着临床相关的变化.
结论:
- 使用qPCR进行表观遗传细胞计数,为免疫监测提供了一种精确而稳定的方法.
- 该技术的性能和衍生的RCV支持其在临床试验和诊断应用中的使用.
- 表观基因qPCR为推进个性化免疫监测和诊断提供了一个有前途的工具.
