基于三个基因签名的舌头癌症预后模型的构建和验证
Haosheng Tan1, Hui Huang, Huaiyu Yang
1Department of Head and Neck Surgical Oncology, National Cancer Center/National Clinical Research Center for Cancer/Cancer Hospital, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Beijing, China.
Medicine
|November 21, 2023
概括
研究人员开发了一种3基因特征 (KRT33B,CDKN2A,CA9) 以预测舌状细胞癌 (TSCC) 患者的结果. 这种生物标志物模型准确地识别高风险个体,提高了这种侵袭性癌症的预后能力.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 舌状细胞癌 (TSCC) 的预后不好,具有破坏性.
- 迫切需要可靠的生物标志物来预测TSCC结果并指导治疗.
- 目前对TSCC的预后工具需要提高临床效用.
研究的目的:
- 开发和验证一种多基因签名,用于预测TSCC患者的预后.
- 创建一个综合临床和病理特征的预后名录,以提高临床适用性.
- 确定新的mRNA生物标志物,以准确预测TSCC结果.
主要方法:
- 使用癌症基因组图谱 (TCGA) 数据集的差异基因表达分析.
- 使用单变量和多变量Cox回归和LASSO回归,开发一个3-mRNA签名 (KRT33B,CDKN2A,CA9).
- 使用一致性指数,ROC分析和Kaplan-Meier生存分析验证模型的准确性.
主要成果:
- 一个包含KRT33B,CDKN2A和CA9的3-mRNA签名成功开发.
- 该模型表现出高预测准确度,一致性指数为0.851,AUC为0.778 (培训) 和0.821 (验证).
- 通过签名识别的高风险患者的生存率明显降低 (P < .001),该模型是一个独立的预后因素 (P < .001).
结论:
- 开发的3基因特征准确地预测了TSCC患者的预后.
- 这种生物标志物模型为评估TSCC的整体存活率提供了有价值的工具.
- 签名作为一个独立的预后因素,增强TSCC治疗的临床决策.
