基于组织和等离子体的高度敏感的阻断器位移片纳米孔测序用于肺癌EGFR突变的肺癌
Patinya Akkhasutthikun1,2, Pornchai Kaewsapsak1,2, Pattaraporn Nimsamer1,3,4
1Department of Biochemistry, Faculty of Medicine, Chulalongkorn University, Bangkok, Thailand.
Cancer research and treatment
|November 21, 2023
概括
一种新的纳米孔测序技术准确地检测了非小细胞肺癌 (NSCLC) 中的表皮生长因子受体 (EGFR) 突变. 这种便携式方法与EGFR 19Del,T790M和L858R突变现有测试具有很高的一致性.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 表皮生长因子受体 (EGFR) 突变是非小细胞肺癌 (NSCLC) 的关键驱动因素,特别是在东亚.
- EGFR突变测试对于指导NSCLC患者的向治疗选择至关重要.
研究的目的:
- 开发一种基于纳米孔测序的新型,便携式技术,用于检测常见的EGFR突变 (19Del,T790M,L858R).
- 评估这种新方法在临床应用中的灵敏度和准确性.
主要方法:
- 使用阻断器位移放大 (BDA) -聚合酶链反应 (PCR) 与纳米孔测序相结合.
- 通过使用工程 EGFR 突变和野生类型克隆,包括低变异基因频率 (VAF) 验证了试验.
- 在临床上验证了该方法,用于来自NSCLC患者的甲固定,嵌 (FFPE) 组织和无细胞DNA (cfDNA).
主要成果:
- 该试验成功检测出EGFR突变,低至0.5%的VAF.
- 在纳米孔测序和Cobas实时PCR对FFPEDNA (98.46%100%) 之间观察到高一致性.
- 在纳米孔测序和滴滴数码PCR之间实现了对cfDNA (94.74%100%) 的优异一致性.
结论:
- BDA安普利康纳米孔测序为EGFR突变检测提供了一个高度准确和敏感的方法.
- 这种便携式技术显示出在NSCLC管理中常规临床使用的巨大潜力.
