下一代先进的基因选:将高通量扰动与单细胞分析结合起来
John A Morris1, Jennifer S Sun1, Neville E Sanjana1
1New York Genome Center, New York, NY 10013, USA; Department of Biology, New York University, New York, NY 10003, USA.
Trends in genetics : TIG
|November 21, 2023
概括
现在,CRISPR屏幕与单细胞多组学集成,揭示遗传变化如何影响细胞状态. 这种强大的组合促进了对生物医学科学中基因功能和疾病机制的理解.
科学领域:
- 生物医学科学 生物医学科学
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 像CRISPR这样的可编程基因组工程技术已经彻底改变了生物医学研究.
- 克里斯普尔屏幕将基因与疾病相关的表型联系起来,但以前仅限于单细胞读数.
- 需要进一步了解复杂的基因扰乱对细胞状态的影响.
研究的目的:
- 审查将CRISPR屏幕与单细胞多组学相结合的技术.
- 突出扩大聚合屏幕的机会,以深入的多式联络表型化.
- 展示遗传干扰对细胞转录组,蛋白质组和表观组的影响.
主要方法:
- 将大规模并行的CRISPR屏幕与高维单细胞概况配对.
- 利用单细胞多组学来测量细胞对遗传干扰的反应.
- 通过深度多式联络表型化扩展聚合屏幕.
主要成果:
- 现在可以将CRISPR屏幕与单细胞多组学相结合,以进行全面的分析.
- 这种方法可以测量转录组,蛋白质组和表观组的变化.
- 单个和组合的遗传乱可以在单细胞分辨率下进行评估.
结论:
- 克里斯普尔屏幕和单细胞多基因组学的整合为基因功能提供了前所未有的见解.
- 这种强大的组合扩大了基因屏的范围,到复杂的细胞表型.
- 未来的研究可以利用这些技术来深入了解疾病生物学.


