使用商业rRT-PCR测定方法优化用于检测SARS-CoV-2的无提取协议
Minhee Kang1,2, Eunjung Jeong1,2, Ji-Yeon Kim3
1Smart Healthcare Research Institute, Biomedical Engineering Research Center, Samsung Medical Center, Seoul, South Korea.
Scientific reports
|November 22, 2023
概括
为COVID-19测试优化样本准备工作至关重要. 将热处理和样本稀释与抑制剂相结合,可以通过rRT-PCR提高对SARS-CoV-2检测的灵敏度.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 病毒学 病毒学
- 诊断微生物学 诊断微生物学
背景情况:
- 实时逆转录聚合酶链反应 (rRT-PCR) 对于COVID-19诊断至关重要.
- 目前的rRT-PCR样本准备通常是耗时的,劳动密集的和资源密集的.
- 针对SARS-CoV-2检测的优化,无提取方法需要进一步调查.
研究的目的:
- 评估用于检测SARS-CoV-2的各种无提取样本准备协议的有效性.
- 研究热处理,样品稀释,RNase抑制剂和蛋白酶K对rRT-PCR敏感性的影响.
- 为了确定COVID-19的简化和成本有效的诊断策略.
主要方法:
- 评估了几种无提取协议,包括热处理,样品稀释和添加蛋白酶K和RNase抑制剂.
- 使用120个SARS-CoV-2阳性和62个阴性临床样本的验证协议.
- 在不同的方法组合中比较诊断灵敏度和周期值 (Ct).
主要成果:
- 样品稀释,热处理,蛋白酶K和RNase抑制剂的组合产生了最高的灵敏度 (84.26%).
- 与热处理相结合的样品稀释显示,与单独热处理相比,灵敏度增加了38% (79.63%).
- 虽然有益,蛋白酶K和RNase抑制剂只提供了边际改善,没有统计学意义.
结论:
- 样品稀释显著提高了无提取式rRT-PCR方法中的SARS-CoV-2检测效率.
- 优化样品制备,特别是稀释和热处理,是提高诊断可访问性和成本效益的关键.
- 对无提取方法的进一步研究可以简化COVID-19测试并提高可持续性.
