可能的人类起源的SARS-CoV-2多基性furin裂变图案
1Biochemistry and Molecular Biology, University Rovira i Virgili, Tarragona, Spain. antonioramon.romeu@iubilo.urv.cat.
BMC genomic data
|November 22, 2023
概括
SARS-CoV-2 病毒很可能通过与人类mRNA重组而获得其独特的furin 分裂模式,而不是来自相关的蝙蝠病毒. 这一发现表明,这种关键病毒特征的潜在人类起源.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- SARS-CoV-2 流行病毒在尖端葡萄糖蛋白 S1/S2 结处具有独特的 PRRA 素裂解图案,在密切相关的蝙蝠冠状病毒中缺席.
- 这种基因的编码子 (CGG-CGG) 在冠状病毒中很少见,这表明它是不同的进化收购.
- 蝙蝠冠状病毒,虽然缺乏动机,但具有与SARS-CoV-2几乎相同的受体结合域,从而使人类细胞感染.
研究的目的:
- 为了调查SARS-CoV-2尖峰 (S) 基因插入的起源,编码PRRA动机.
- 将SARS-CoV-2 S基因插入序列与人类mRNA转录进行比较.
主要方法:
- 详细的序列分析比较SARS-CoV-2 S基因插入 (PRRA动机) 与人类mRNA转录.
- 用匹配S基因插入的mRNA序列识别人类基因.
主要成果:
- 在SARS-CoV-2 S基因插入和几个人类mRNA转录之间发现了100%的序列匹配.
- 匹配的人类基因包括无处不在的转录 (例如,ATP5F1,USP21) 和与SARS-CoV-2感染相关的组织特定基因.
- 在动图中注意到罕见的CGG-CGG密码子对氨酸的使用.
结论:
- 这些发现支持了对SARS-CoV-2多基素分裂动机可能的人类起源的假设.
- 建议将SARS-CoV-2祖先和人类mRNA转录之间的重组作为S基因插入的来源.
- 氨酸子中的同义基替代和额外的PRRA类插入意味着这种获取可能涉及多个事件.
相关概念视频
Single Nucleotide Polymorphisms-SNPs
15.2K
A single nucleotide polymorphism or SNP is a single nucleotide variation at a specific genomic position in a large population. It is the most prevalent type of sequence variation found in the human genome. Point mutations that occur in more than 1% of the population qualify as SNPs. These are present once every 1000 nucleotides on an average in the human genome. Replacement of a purine with another purine (A/G) or a pyrimidine with another pyrimidine (C/T) is known as a transition. In contrast,...
15.2K
Leaky Scanning
5.1K
During most eukaryotic translation processes, the small 40S ribosome subunit scans an mRNA from its 5' end until it encounters the first start AUG codon. The large 60S ribosomal subunit then joins the smaller one to initiate protein synthesis. The location of the translation initiation is largely determined by the nucleotides near the start codon as there may be multiple translation initiation sites present on the mRNA. Marilyn Kozak discovered that the sequence RCCAUGG (where R...
5.1K


