综合生物信息学方法用于调查感染人类细胞系模型的转录组形状的变化
Gangga Anuraga1, Jilu Lang2, Do Thi Minh Xuan3
1PhD Program for Cancer Molecular Biology and Drug Discovery, College of Medical Science and Technology, Taipei Medical University and Academia Sinica, Taipei 11031, Taiwan; Department of Statistics, Faculty of Science and Technology, Universitas PGRI Adi Buana, Surabaya, East Java 60234, Indonesia.
Journal of infection and public health
|November 22, 2023
概括
病毒 (MPV) 感染会影响各种细胞通路. 早期的MPV感染会影响新陈代谢和病毒复制,而后来的阶段会影响免疫力和细胞运动,为mpox病原体提供了洞察力.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 细胞生物学 细胞生物学
背景情况:
- 猿病毒 (MPV) 疫情引起了全球健康的关注.
- 众所周知,MPV是一种类似天花的病毒,可以抑制一些免疫通路.
- 麻疹病毒对其他免疫信号通路的全部影响仍然在很大程度上未知.
研究的目的:
- 研究MPV感染对人类上皮细胞的时间影响.
- 为了确定不同时间点由MPV感染改变的同调节基因和细胞通路.
主要方法:
- 用两个潜伏期: 2 小时和 12 小时,感染 HeLa 细胞的 MPV.
- 利用了基因本体学,基因和基因组的京都百科全书和MetaCore进行途径分析.
主要成果:
- MPV感染丰富了包括Notch,CD40,CD95,HIF-1α,IL-1,IL-6,PI3K,NF-κB,MAPK和氧化应激在内的路径.
- 早期 (2小时) 感染与代谢和病毒复制途径相关 (例如,HSPG2,CA9).
- 晚些时候 (12小时) 感染与免疫和细胞运动途径相关 (例如IL8,MMP1).
结论:
- 这项研究提高了对mopox病理生理学和感染后影响的理解.
- 调查结果显示,MPV引起的明显的时间免疫路径失调.
- 提供了关于MPV感染多方面的机制的见解.
