来自缅甸的一个广泛耐药的Pseudomonas aeruginosa分离物

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 公共卫生 公共卫生

背景情况:

• 抗菌素耐药性 (AMR),包括多药耐药性 (MDR) 和广泛耐药性 (XDR) 菌株,构成了全球重大健康挑战.
• 东南亚是抗菌素耐药细菌的公认热点,从缅甸获得的数据有限.
• 缅甸面临着传染病的高负担,因此对抗性病原体的研究至关重要.

研究的目的:

• 报告来自缅甸的XDR Pseudomonas aeruginosa分离体的基因组草案.
• 描述已识别的XDR P. aeruginosa的抗生素耐药性概况和遗传组成.
• 评估这一发现对区域抗菌素耐药性监测的影响.

主要方法:

• 使用标准方法对MMXDRPA001分离物的抗生素耐药性进行分析.
• 全基因组测序 (WGS) 使用Illumina MiSeq平台.
• 基因组组装,注释和预测抗微生物耐药性和毒性基因,然后使用核心基因组SNP进行基因组分析.

主要成果:

• P. aeruginosa MMXDRPA001 隔离物对多种抗假体抗生素,包括β-乳酸,氨基甘油酸和类药物,表现出耐药性.
• 全基因组测序结果是145个contigs (6,808,493 bp) 的组合,其中有6183个编码序列.
• 该分离物被确定为序列类型 (ST) 235,携带编码卡巴酶基因的blaIMP-1,并与泰国先前报告的一种分离物表现出克隆相关性.

结论:

• 在缅甸存在一种国际高风险克隆 (ST235 XDR P. aeruginosa),与邻国有关,这是一个重大的公共卫生问题.
• 这一发现强调,迫切需要在缅甸和更广泛的东南亚地区的医疗保健机构加强和协调抗菌素耐药性监测.