基于生物信息学分析和实验验证,SEL1L3作为细胞癌和动脉样硬化之间的分子链接

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 心血管生物学 心血管生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 清细胞癌起源于管状表皮.
• 大动脉动脉样硬化是动脉样硬化的主要原因,但机制尚不清楚.

研究的目的:

• 研究SEL1L3在清细胞癌和动脉样硬化中的作用.
• 为了确定这两个条件之间的潜在分子联系.

主要方法:

• 使用癌症基因组图谱 (TCGA) 进行脏清细胞癌RNA测序和基因表达总汇 (GEO) 进行动脉样硬化数据集.
• 采用LIMA和蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络分析来识别差异表达和枢纽基因.
• 进行功能丰富,存活和免疫细胞透分析,以及用于途径分析的西部涂抹.

主要成果:

• 在三个数据集中确定了15个常见的差异表达基因 (DEG),其中SEL1L3被确定为核心基因.
• 较低的SEL1L3表达与脏清细胞癌的更差预后有关.
• SEL1L3表达与免疫细胞透有显著的相关性,包括B细胞和巨细胞.

结论:

• 在清细胞癌和动脉样硬化中,SEL1L3起着重要作用.
• SEL1L3可能代表一个潜在的分子链接连接癌和大动脉动脉样硬化.