在肝细胞癌中,编程细胞死亡相关基因的诊断作用和免疫相关物
Zhanao He1, Jie Zhang2, Wukui Huang3
1Department of Interventional Diagnosis and Treatment, The Affiliated Tumor Hospital of Xinjiang Medical University, Ürümqi, 830011, China.
Scientific reports
|November 22, 2023
概括
编程细胞死亡 (PCD) 在肝癌中起作用. 使用PCD基因 (如SERPINE1和G6PD) 的新指数 (PCDI) 可以预测肝细胞癌 (HCC) 的预后,并确定免疫细胞相关性.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 编程细胞死亡 (PCD) 与瘤发育有关.
- 了解PCD相关基因对于诊断和预测肝细胞癌 (HCC) 的预后至关重要.
研究的目的:
- 综合分析PCD相关基因在HCC中的诊断和预后价值.
- 确定关键基因并开发HCC患者预测结果的预测指数.
主要方法:
- 利用了公开的基因表达和来自HCC患者的单细胞数据.
- 执行单变量和多变量考克斯回归,共识聚类和LASSO分析.
- 经过验证的基因表达和免疫细胞透通过qPCR,西斑和流细胞计.
主要成果:
- 在HCC中鉴定出52个差异表达的PCD相关基因.
- 开发了一种编程细胞死亡指数 (PCDI),该指数将患者分为高风险和低风险组,高PCDI表明预后较差.
- 发现SERPINE1和G6PD显著影响生存,与巨细胞和Treg透相关;G6PD表达在巨细胞中,SERPINE1在纤维细胞中.
结论:
- PCDI作为HCC的独立预后因素.
- 塞尔宾1和G6PD的表达及其与免疫微环境的关联为HCC提供了潜在的治疗点.
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