对胃腺癌的预后风险模型的构建,该模型基于内分泌网膜压力基因
Xi Li1, Yuehua Lei2
1Department of General Surgery, Zigong Fourth People's Hospital, No. 19 Tanmulin Street, Ziliujing District, 643000, Zigong City, Sichuan Province, China.
Wiener klinische Wochenschrift
|November 22, 2023
概括
这项研究开发了一个12基因预后模型,用于胃腺癌 (STAD) 基于内分泌网膜 (ER) 压力基因. 该模型有效地预测了患者的结果,并确定了具有不同免疫透水平的不同STAD亚组.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 胃腺癌 (STAD) 的发病率很高,预后不佳,需要新的预后工具.
- 癌细胞对细胞内网膜 (ER) 压力的敏感性表明它在STAD病原发生过程中的潜在作用.
研究的目的:
- 建立STAD使用ER压力相关特征基因的预后风险模型.
- 识别不同的STAD亚型并分析免疫透模式.
主要方法:
- 下载并分析了癌症基因组图谱 (TCGA) -STAD数据集,以识别差异表达基因 (DEG).
- 与ER压力基因交叉DEG,以识别与ER压力相关的DEG.
- 采用K-means集群用于STAD亚型,ssGSEA用于免疫透分析,以及Cox回归用于预后模型构建.
- 通过生存分析,ROC曲线和GSEA验证了模型,并生成了一个名ogram.
主要成果:
- 在STAD中确定了162个与ER压力相关的DEG.
- 将STAD分为三个分组,具有不同的免疫透水平.
- 开发了一个具有良好的预测性能的12基因预后模型 (MATN3,ATP2A1,NOX4,AQP11,HP,CAV1,STARD3,FKBP10,EGF,F2,SERPINE1,CNGA3).
- 通过名图表证明了模型作为预后因素的独立性及其良好的预测能力.
结论:
- STAD可以分为三个不同的子组.
- 基于12基因ER压力特征的模型显示了STAD患者的显著预后价值.
