在大鼠肝脏样本中检测体内突变性,使用经过错误纠正的测序技术

科学领域:

• 毒理学 毒理学 毒理学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 突变性评估对于人类健康和环境安全至关重要.
• 在体内动物模型,特别是老鼠,对于评估由于共享代谢途径的变异性至关重要.
• 目前转基因动物 (TGR) 在体内突变性测定是劳动密集型的,仅限于转基因突变.

研究的目的:

• 评估配对结尾和补充共识测序 (PECC-Seq) 的有效性,用于在老鼠肝脏中直接体内致变性检测.
• 建立PECC-Seq作为传统TGR分析的可行替代方案.

主要方法:

• 利用PECC-Seq,一种错误纠正的下一代测序技术,用于直接检测大鼠肝脏DNA中的体质突变.
• 给大鼠用已知变异原体二甲基尼托拉胺 (DEN) 诱导突变.
• 将PECC-Seq结果与传统TGR测定数据进行比较.

主要成果:

• PECC-Seq成功地检测到在没有位点或生物体约束的情况下,在大鼠肝脏样本中超罕见的体质突变.
• 从PECC-Seq和TGR测定中观察到突变频率之间的有希望的相关性.
• PECC-Seq准确地确定了特定突变 (A:T > T:A) 和DEN诱导的突变特征.

结论:

• PECC-Seq在老鼠肝样本中有效检测体内突变性.
• 这种技术为TGR试验提供了一种劳动和时间效率高的替代方案,消除了对转基因动物的需求.
• 错误纠正测序对促进突变致病性评估和监管科学有很大的前景.