通过in-silico查识别具有与SARS-CoV-2尖端蛋白高度亲和力的五糖化合物
Binjie Li1, Tianji Zhang2, Hui Cao3
1Beijing Advanced Innovation Center for Soft Matter Science and Engineering, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, China.
International journal of molecular sciences
|November 25, 2023
概括
研究人员开发了14,112个糖库,以阻止SARS-CoV-2 (严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2) 感染细胞. 这种化合物对病毒的尖端蛋白受体结合域具有很高的亲和力,这表明它有可能作为一种抗病毒剂.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 病毒学 病毒学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 在SARS-CoV-2尖峰 (S) 蛋白通过与宿主细胞受体相互作用来调解病毒的进入.
- 肝素硫酸盐 (HS) 在宿主细胞上充当附着因子,促进S蛋白的受体结合域 (RBD) 与ACE2的结合.
- 干扰HS-RBD相互作用是抑制SARS-CoV-2感染的潜在策略.
研究的目的:
- 设计和选一个糖库,以识别抑制HS-RBD相互作用的化合物.
- 通过分子建模和药物相似性分析评估化合物的抗病毒潜力.
- 开发新的HS模仿剂作为抗SARS-CoV-2药物.
主要方法:
- 合成了14,112个带有各种硫酸盐替代物的糖体库.
- 进行了对图书馆针对SARS-CoV-2 RBD的虚拟查.
- 用分子建模和药物相似性计算来评估化合物的特性.
主要成果:
- 虚拟选确定了可能干扰HS-RBD结合的顶部冲击糖类.
- 五糖化物对SARS-CoV-2 RBD具有很高的亲和力.
- 药物相似性分析表明,与现有的HS模拟剂相比,化合物具有有利的特性.
结论:
- 该研究成功开发并选了一种糖库,用于潜在的SARS-CoV-2抑制剂.
- 鉴定出一种型糖化物,对病毒RBD有很高的亲和力,具有有前途的类似药物特征.
- 这些发现支持HS模仿剂的发展,作为一种新型抗病毒疗法,用于对抗SARS-CoV-2.
