含有Pyrene和修饰光化学反应型氨酸的二:与多核酸结合的非共价和共价结合
Igor Sviben1, Mladena Glavaš1, Antonija Erben1
1Department of Organic Chemistry and Biochemistry, Ruđer Bošković Institute, Bijenička cesta 54, 10000 Zagreb, Croatia.
Molecules (Basel, Switzerland)
|November 25, 2023
概括
新的光可以以可逆或共的方式标记多核酸. 这些分子具有高亲和力结合DNA/RNA,在暴露于光线时可以转化为永久标签,从而使生物医学中的双重标签应用成为可能.
科学领域:
- 化学生物学 化学生物学
- 生物物理化学 生物物理化学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 开发用于多核酸标记的新型光探针对于分子生物学和诊断至关重要.
- 现有的方法往往缺乏在可逆和不可逆的标签之间切换的能力.
- 非天然的氨基酸为创建复杂的分子探针提供了多功能构建块.
研究的目的:
- 合成和描述具有多核酸双光标记能力的新型二.
- 研究这些二的光物理性质和多核酸结合特性.
- 为了证明光诱导对寡核酸的共价标签的原理证明.
主要方法:
- 合成含 pyrene 的非天然氨基酸和改性 tyrosine.
- 稳态和时间分辨率光谱学以确定光物理性质.
- 准备性光甲醇分析用于研究光化学反应性和金甲基生成.
- 用多核酸结合研究来评估亲和力和结合点 (小沟,富含AT的区域).
主要成果:
- 在低度下,二基1和2表现出光 (Φf = 0.3-0.4) 和极小的排外体形成.
- 这两种都具有光化学反应性,经过去胺化形成甲基 (ΦR = 0.01-0.02).
- 稳定复合物与多核酸 (log Ka > 6) 通过非共价相互作用形成,主要是在富含AT的小槽区域.
- 2具有较长的间距,显示出更有效的除.
- 复合物2·oligoAT10的光激发导致金甲基的光生成和随后的化,从而产生光标签.
结论:
- 合成的二酸具有对多核酸的双光标记能力.
- 这些分子可以与DNA/RNA形成高亲和度,可逆的非共价复合体.
- 光照射将非共价复合物转化为不可逆转的共价标签.
- 这种双重标签策略在生物医学科学中提供了多方面的应用.
