在人血清中识别了具有纳米颗粒蛋白冠状病毒的开放式读取框架编码的小
Mingbo Peng1, Yutian Zhou1, Yi Wang1
1School of Life Sciences and Hubei Key Laboratory of Genetic Regulation and Integrative Biology, Central China Normal University, Wuhan, Hubei 430079, People's Republic of China.
Journal of proteome research
|November 25, 2023
概括
纳米粒子蛋白质冠状体有效地丰富了来自人血清的低分子量蛋白 (LMWPs),包括小型开放式读取框架编码 (SEPs). 这种新的方法增强了用于生物标志物发现的SEP检测.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 纳米技术 纳米技术
背景情况:
- 血清中的低分子量蛋白 (LMWPs) 与人类疾病有关,并作为潜在的生物标志物.
- 小开放式读取编码 (SEP) 是一种具有多样化的生物功能和存在于人体血液中的LMWP类.
- 通过质谱测量检测LMWPs是具有挑战性的,因为血清和血中蛋白质度的动态范围广泛.
研究的目的:
- 开发一种有效的方法来分析人血清中的小型开放式读取框架编码 (SEPs).
- 评估纳米粒子蛋白质冠冕对丰富SEP的有效性.
- 为了确定人类疾病的新型SEP生物标志物.
主要方法:
- 纳米粒子蛋白质冠状体与液体染色学/并联质谱学 (LC/MS/MS) 的整合.
- 使用了三种类型的纳米粒子:TiO2,Fe3O4@SiO2和Fe3O4@SiO2@TiO2用于蛋白质丰富.
- 基于纳米粒子的提取与传统的基于乙尼的提取进行了比较.
主要成果:
- 使用开发的协议,在人血清中确定了164种新的SEP.
- Fe3O4@SiO2纳米颗粒和纳米颗粒混合物分别产生了最高的SEP数量和比例.
- 纳米颗粒蛋白质冠状表现出更广泛的小型蛋白质和SEP的覆盖范围,而不是酸提取.
- 磁纳米粒子促进了适合LC/MS的高通量并行分离.
结论:
- 集成的纳米颗粒蛋白冠状和LC/MS/MS协议是SEP分析的快速,高效和可重复的方法.
- 这种方法显著改善了人类血清中SEP的检测和识别.
- 该方法适用于高通量应用,有利于SEP和疾病生物标志物的研究.
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