在自闭症谱系障碍中对差异性基因的查和生物信息学分析,基于GEO数据库
Jinyi Zhu1, Haoran Meng1, Yan Li2
1Affiliated Hospital of Weifang Medical University, School of clinical medicine, Weifang Medical University, Weifang, China.
Studies in health technology and informatics
|November 26, 2023
概括
在患有自闭症谱系障碍 (ASD) 的儿童中,确定了10个关键基因和相关的微RNA. 这些发现为ASD提供了潜在的新生物标志物和治疗点.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 发展生物学 发展生物学
背景情况:
- 自闭症谱系障碍 (ASD) 的患病率正在上升,影响儿童的生活质量.
- 可能的原因包括基因表达,炎症和免疫功能障碍,但机制尚不清楚.
研究的目的:
- 确定关键的基因和参与自闭症谱系障碍 (ASD) 的监管网络.
- 探索潜在的诊断生物标志物和ASD的治疗点.
主要方法:
- 使用GEO数据库 (GSE77103) 分析了自闭症儿童的基因表达数据.
- 使用STRING和Cytoscape构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络并确定了枢纽基因.
- 为已识别的枢纽基因构建了一个microRNA-mRNA调节网络.
主要成果:
- 在患有ASD的儿童中鉴定出551个差异表达基因 (DEGs).
- 选了10个与ASD发展密切相关的枢纽基因 (例如MX1,ISG15,IRF7).
- 构建了一个miRNA-mRNA调节网络,突出了像has-miR-27a-5p.p.这样的潜在调节者.
结论:
- 确定了10个枢纽基因 (MX1,ISG15,IRF7,DDX58,IFIT1,BCL2L1,HPGDS,CTSD,PTGS2,CD68),这些基因对ASD至关重要.
- 这些基因和相关的miRNAs可能在ASD病变发生过程中发挥重要作用.
- 这些发现为ASD治疗提供了潜在的生物标志物和治疗点.
