小麦条纹抗基位点YR63是防御基因进化的热点 - - 一个泛基因组的发现
Amy Mackenzie1,2, Michael Norman1,3, Mesfin Gessese3,4
1Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization Agriculture and Food, Canberra, Australian Capital Territory, 2601, Australia.
条纹抗基因YR63被映射到小麦的染色体7B上. 一种密切相关的SNP标志物将有助于提高对Puccinia striiformis f. sp.的抗性. 三子 (Pst) 的意思.
科学领域:
- 植物遗传学和育种.
- 分子植物病理学 分子植物病理学
- 小麦基因组学 小麦基因组学
背景情况:
- 条纹生,是由Puccinia striiformis f. sp. 引起的 三 (Pst),对全球小麦产量构成重大威胁.
- 有效的耐药基因对于控制Pst.至关重要.
- 这项研究的重点是绘制葡萄牙小麦陆地品种的YR63条纹抗基因.
研究的目的:
- 为了绘制YR63条纹抗基因的地图.
- 开发用于YR63入侵精英小麦品种的分子标记物.
- 要了解YR63.3的遗传背景.
主要方法:
- 基于地图的克隆使用单核酸多态 (SNP) 标记.
- 针对性基因型测序 (tGBS) 和突变发生,耐药性基因丰富和测序 (MutRenSeq).
- RNA测序 (RNASeq) 和比较基因组学.
主要成果:
- YR63被映射到7B染色体的短臂,在SNP标记物sunCS_YR63和sunCS_67.63之间.
- YR63位于一个富含基因的热点,其中含有核酸结合和富含白素的重复基因 (NLR) 和酶编码基因.
- 一种与YR63密切相关的SNP标志物在澳大利亚小麦, durum和triticale品种中被确定并验证.
结论:
- YR63是澳大利亚和全球小麦育种中Pst耐药性的宝贵来源.
- 开发的SNP标记器促进了快速YR63内进化的标记器辅助选择.
- 建议使用长读测序技术来准确地描述复杂基因集群中的耐药性基因.
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